Programa de Pós-Graduação em Estatística

Produção Científica do Período de 2012 a 2025

Foto de Benilton De Sa Carvalho
Rank: 75

Benilton De Sa Carvalho

Possui graduação e mestrado em Estatística pela UNICAMP e doutorado em Bioestatística pela Universidade Johns Hopkins. Foi Pesquisador Associado no Departamento de Oncologia da Universidade de Cambridge, Professor Afiliado do Instituto de Biologia Computacional de Cambridge, Pesquisador Associado Honorário no Grupo de Biologia Computacional do Cancer Research UK e pesquisador associado ao Departamento de Genética Médica da Faculdade de Ciências Médicas da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) e Desenvolvedor no Projeto Bioconductor desde 2004. Atualmente, é Professor Associado e Chefe do Departamento de Estatística da UNICAMP. Benilton possui experiência no gerenciamento e análise de grandes bases de dados, tendo como foco de pesquisa o desenvolvimento de metodologias analíticas e ferramentas computacionais em Biologia Computacional e Bioinformática voltadas para dados originados por experimentos de microarranjo e sequenciamento, com aplicações em -ômicas.
Currículo Lattes Google Acadêmico ORCID

Informações Gerais

  • Nome Completo: Benilton De Sa Carvalho
  • ID Lattes: 0897291971174045
  • Categoria:
  • Tipo Bolsa CNPq: Produtividade em Pesquisa
  • Categoria Bolsa CNPq: 2
  • Períodos: ['2016-2026']
  • Subgrupo: docentes
  • Período(s) de análise: 2016-2026
  • Endereço: Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Matemática Estatística e Ciência da Computação. Rua Sérgio Buarque de Holanda, 651 CEP 13083859 - Campinas, SP.

Áreas de Atuação

Ciências Biológicas → Genética → Bioinformática Ciências Exatas e da Terra → Probabilidade e Estatística → Probabilidade e Estatística Aplicadas → Estatística Genética Ciências Exatas e da Terra → Probabilidade e Estatística → Probabilidade e Estatística Aplicadas → Bioestatística Ciências Biológicas → Genética → Genética Humana e Médica Ciências Exatas e da Terra → Probabilidade e Estatística → Biologia Computacional Ciências Exatas e da Terra → Probabilidade e Estatística → Probabilidade e Estatística Aplicadas → Estatística Computacional

Formação Acadêmica

Graduação
Estatística
Universidade Estadual de Campinas
1997-2000
Mestrado
Estatística
Universidade Estadual de Campinas
2001-2003
Doutorado
Bioestatística
Johns Hopkins University
2003-2008
Pós-doutorado
University of Cambridge
2010-2012
Pós-doutorado
Universidade Estadual de Campinas
2013-2015
Livre Docência
Universidade Estadual de Campinas
2022

Colaborações Endógenas

Hildete Prisco Pinheiro
2 colaborações
Marina Vachkovskaia
0 colaborações
Larissa Avila Matos
1 colaborações
Camila Pedroso Estevam
0 colaborações
Jean Carlo Guella
0 colaborações
Atenção: As informações de produção listadas a seguir referem-se exclusivamente ao período de análise considerado no presente relatório, bem como ao período, ou períodos, em que o membro esteve na instituição. Para verificar a produção completa do membro, consulte o seu Currículo Lattes.

Produção Bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos
VIEIRA, A. S.; DE MATOS, A. H.; DO CANTO, A. M.; ROCHA, C. S.; CARVALHO, B. S.; PASCOAL, V. D. B.; NORWOOD, B.; BAUER, S.; ROSENOW, F.; GILIOLI, R.; CENDES, F.; LOPES-CENDES, I. RNA sequencing reveals region-specific molecular mechanisms associated with epileptogenesis in a model of classical hippocampal sclerosis. Scientific Reports (ISSN: 20452322). v. 6. 2016.
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ROBERTSON, A. GORDON; KIM, JAEGIL; AL-AHMADIE, HIKMAT; BELLMUNT, JOAQUIM; GUO, GUANGWU; CHERNIACK, ANDREW D.; HINOUE, TOSHINORI; LAIRD, PETER W.; HOADLEY, KATHERINE A.; AKBANI, REHAN; CASTRO, MAURO A.A.; GIBB, EWAN A.; KANCHI, RUPA S.; GORDENIN, DMITRY A.; SHUKLA, SACHET A.; SANCHEZ-VEGA, FRANCISCO; HANSEL, DONNA E.; CZERNIAK, BOGDAN A.; REUTER, VICTOR E.; CARVALHO, B. S.; et.al Comprehensive Molecular Characterization of Muscle-Invasive Bladder Cancer. CELL (ISSN: 00928674). v. 171. 2017.
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AVANSINI, SIMONI H.; DE SOUSA LIMA, BEATRIZ PEREIRA; SECOLIN, RODRIGO; SANTOS, MARILZA L.; COAN, ANA CAROLINA; VIEIRA, ANDRÉ S.; TORRES, FÁBIO R.; CARVALHO, B. S.; ALVIM, MARINA K. M.; MORITA, MÁRCIA E.; YASUDA, CLARISSA L.; PIMENTEL-SILVA, LUCIANA R.; DOGINI, DANYELLA B.; ROGERIO, FABIO; CENDES, FERNANDO; LOPES-CENDES, ISCIA MicroRNA hsa-miR-134 is a circulating biomarker for mesial temporal lobe epilepsy. PLoS One (ISSN: 19326203). v. 12. 2017.
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SILVA-ALVES, MARIANA S.; SECOLIN, RODRIGO; CARVALHO, B. S.; YASUDA, CLARISSA L.; BILEVICIUS, ELIZABETH; ALVIM, MARINA K. M.; SANTOS, RENATO O.; MAURER-MORELLI, CLAUDIA V.; CENDES, FERNANDO; LOPES-CENDES, ISCIA A Prediction Algorithm for Drug Response in Patients with Mesial Temporal Lobe Epilepsy Based on Clinical and Genetic Information. PLoS One (ISSN: 19326203). v. 12. 2017.
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BARBALHO, PATRÍCIA GONÇALVES; CARVALHO, BENILTON DE SÁ; LOPES-CENDES, ISCIA; MAURER-MORELLI, CLAUDIA VIANNA Cyclooxygenase-1 as a Potential Therapeutic Target for Seizure Suppression: Evidences from Zebrafish Pentylenetetrazole-Seizure Model. Frontiers in Neurology (ISSN: 16642295). v. 7. 2016.
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DE ANDRADE, HELEN M.T.; DE ALBUQUERQUE, MILENA; AVANSINI, SIMONI H.; DE S. ROCHA, CRISTIANE; DOGINI, DANYELLA B.; NUCCI, ANAMARLI; CARVALHO, B. S.; LOPES-CENDES, ISCIA; FRANÇA, MARCONDES C. MicroRNAs-424 and 206 are potential prognostic markers in spinal onset amyotrophic lateral sclerosis. JOURNAL OF THE NEUROLOGICAL SCIENCES (ISSN: 0022510X). v. 368. 2016.
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SOUZA, W.; CARVALHO, B. S.; CENDES, I. T. L. Rqc : A Bioconductor Package for Quality Control of High-Throughput Sequencing Data. Journal of Statistical Software (ISSN: 15487660). v. 87. 2018.
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AVANSINI, SIMONI H.; TORRES, FÁBIO R.; VIEIRA, ANDRÉ S.; DOGINI, DANYELLA B.; ROGERIO, FABIO; COAN, ANA C.; MORITA, MARCIA E.; GUERREIRO, MARILISA M.; YASUDA, CLARISSA L.; SECOLIN, RODRIGO; CARVALHO, B. S.; BORGES, MURILO G.; ALMEIDA, VANESSA S.; ARAÚJO, PATRÍCIA A. O. R.; QUEIROZ, LUCIANO; CENDES, FERNANDO; LOPES-CENDES, ISCIA Dysregulation of NEUROG2 plays a key role in focal cortical dysplasia. ANNALS OF NEUROLOGY (ISSN: 03645134). v. 83. 2018.
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ROBERTSON, A. GORDON; KIM, JAEGIL; AL-AHMADIE, HIKMAT; BELLMUNT, JOAQUIM; GUO, GUANGWU; CHERNIACK, ANDREW D.; HINOUE, TOSHINORI; LAIRD, PETER W.; HOADLEY, KATHERINE A.; AKBANI, REHAN; CASTRO, MAURO A.A.; GIBB, EWAN A.; KANCHI, RUPA S.; GORDENIN, DMITRY A.; SHUKLA, SACHET A.; SANCHEZ-VEGA, FRANCISCO; HANSEL, DONNA E.; CZERNIAK, BOGDAN A.; REUTER, VICTOR E.; CARVALHO, B. S.; et.al Comprehensive Molecular Characterization of Muscle-Invasive Bladder Cancer. CELL (ISSN: 00928674). v. 174. 2018.
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HENNING, BARBARA; DE SÁ CARVALHO, BENILTON; PIRES, MATHIAS M.; BASSOI, MANUELA; MARIGO, JULIANA; BERTOZZI, CAROLINA; ARAÚJO, MÁRCIO S. Geographical and intrapopulation variation in the diet of a threatened marine predator, Pontoporia blainvillei (Cetacea). BIOTROPICA (ISSN: 00063606). v. 50. 2018.
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NOGUEIRA JORGE, NATASHA ANDRESSA; WAJNBERG, GABRIEL; FERREIRA, CARLOS GIL; DE SA CARVALHO, BENILTON; PASSETTI, FABIO snoRNA and piRNA expression levels modified by tobacco use in women with lung adenocarcinoma. PLoS One (ISSN: 19326203). v. 12. 2017.
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RODRIGUES'PERES, RAQUEL M.; S. CARVALHO, BENILTON; ANURAG, MEENAKSHI; LEI, JONATHAN T.; CONZ, LIVIA; GONÇALVES, RODRIGO; CARDOSO FILHO, CÁSSIO; RAMALHO, SUSANA; PAIVA, GEISILENE R.; DERCHAIN, SOPHIE F. M.; LOPES'CENDES, ISCIA; ELLIS, MATTHEW J.; SARIAN, LUIS O. Copy number alterations associated with clinical features in an underrepresented population with breast cancer. MOLECULAR GENETICS & GENOMIC MEDICINE (ISSN: 23249269). v. 7. 2019.
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GONSALES, MARINA C.; MONTENEGRO, MARIA AUGUSTA; PRETO, PAULA; GUERREIRO, MARILISA M.; COAN, ANA CAROLINA; QUAST, MONICA PAIVA; CARVALHO, B. S.; LOPES-CENDES, ISCIA Multimodal Analysis of SCN1A Missense Variants Improves Interpretation of Clinically Relevant Variants in Dravet Syndrome. Frontiers in Neurology (ISSN: 16642295). v. 10. 2019.
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DO CANTO, AMANDA M.; VIEIRA, ANDRÉ S.; H.B. MATOS, ALEXANDRE; CARVALHO, B. S.; HENNING, BARBARA; NORWOOD, BRAXTON A.; BAUER, SEBASTIAN; ROSENOW, FELIX; GILIOLI, ROVILSON; CENDES, FERNANDO; LOPES-CENDES, ISCIA Laser microdissection-based microproteomics of the hippocampus of a rat epilepsy model reveals regional differences in protein abundances. Scientific Reports (ISSN: 20452322). v. 10. 2020.
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SECOLIN, RODRIGO; MAS-SANDOVAL, ALEX; ARAUNA, LARA R.; TORRES, FÁBIO R.; DE ARAUJO, TÂNIA K.; SANTOS, MARILZA L.; ROCHA, CRISTIANE S.; CARVALHO, B. S.; CENDES, FERNANDO; LOPES-CENDES, ISCIA; COMAS, DAVID Distribution of local ancestry and evidence of adaptation in admixed populations. Scientific Reports (ISSN: 20452322). v. 9. 2019.
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MARUYAMA, SANDRA R.; CARVALHO, B. S.; GONZÁLEZ-PORTA, MAR; RUNG, JOHAN; BRAZMA, ALVIS; GUSTAVO GARDINASSI, LUIZ; FERREIRA, BEATRIZ R.; BANIN, TAMY M.; VERÍSSIMO, CECÍLIA J.; KATIKI, LUCIANA M.; DE MIRANDA-SANTOS, ISABEL K. F. Blood transcriptome profile induced by an efficacious vaccine formulated with salivary antigens from cattle ticks. npj Vaccines (ISSN: 20590105). v. 4. 2019.
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ROCHA, CRISTIANE S.; SECOLIN, RODRIGO; RODRIGUES, MAÍRA R.; CARVALHO, B. S.; LOPES-CENDES, ISCIA The Brazilian Initiative on Precision Medicine (BIPMed): fostering genomic data-sharing of underrepresented populations. npj Genomic Medicine (ISSN: 20567944). v. 5. 2020.
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HOUNKPE, BIDOSSESSI WILFRIED; BENATTI, RAFAELA DE OLIVEIRA; CARVALHO, BENILTON DE SÁ; DE PAULA, ERICH VINICIUS Identification of common and divergent gene expression signatures in patients with venous and arterial thrombosis using data from public repositories. PLoS One (ISSN: 19326203). v. 15. 2020.
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LOURENÇO, GUSTAVO JACOB; OLIVEIRA, CRISTIANE; CARVALHO, BENILTON SÁ; TORRICELLI, CAROLINE; SILVA, JANET KELLER; GOMEZ, GABRIELA VILAS BÔAS; RINCK-JUNIOR, JOSÉ AUGUSTO; OLIVEIRA, WESLEY LIMA; VAZQUEZ, VINICIUS LIMA; SERRANO, SERGIO VICENTE; MORAES, APARECIDA MACHADO; LIMA, CARMEN SILVIA PASSOS Inherited variations in human pigmentation-related genes modulate cutaneous melanoma risk and clinicopathological features in Brazilian population. Scientific Reports (ISSN: 20452322). v. 10. 2020.
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GARCIA-ROSA, SHEILA; CARVALHO, B. S.; GUEST, PAUL C.; STEINER, JOHANN; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL Blood plasma proteomic modulation induced by olanzapine and risperidone in schizophrenia patients. Journal of Proteomics (ISSN: 18743919). v. 224. 2020.
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CORBI, SÂMIA C. T.; DE VASCONCELLOS, JAIRA F.; BASTOS, ALLINY S.; BUSSANELI, DIEGO GIROTTO; DA SILVA, BÁRBARA ROQUE; SANTOS, RAQUEL ALVES; TAKAHASHI, CATARINA S.; DE S. ROCHA, CRISTIANE; CARVALHO, BENILTON DE SÁ; MAURER-MORELLI, CLÁUDIA V.; ORRICO, SILVANA R. P.; BARROS, SILVANA P.; SCAREL-CAMINAGA, RAQUEL M. Circulating lymphocytes and monocytes transcriptomic analysis of patients with type 2 diabetes mellitus, dyslipidemia and periodontitis. Scientific Reports (ISSN: 20452322). v. 10. 2020.
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BORGES, MURILO G.; ROCHA, CRISTIANE S.; CARVALHO, B. S.; LOPES-CENDES, ISCIA Methodological differences can affect sequencing depth with a possible impact on the accuracy of genetic diagnosis. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY (ONLINE VERSION) (ISSN: 16784685). v. 43. 2020.
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WAY, GREGORY P.; GREENE, CASEY S.; CARNINCI, PIERO; CARVALHO, B. S.; DE HOON, MICHIEL; FINLEY, STACEY D.; GOSLINE, SARA J. C.; L' CAO, KIM-ANH; LEE, JERRY S. H.; MARCHIONNI, LUIGI; ROBINE, NICOLAS; SINDI, SUZANNE S.; THEIS, FABIAN J.; YANG, JEAN Y. H.; CARPENTER, ANNE E.; FERTIG, ELANA J. A field guide to cultivating computational biology. PLOS BIOLOGY (ISSN: 15457885). v. 19. 2021.
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SILVEIRA, KARINA C.; KANAZAWA, THATIANE Y.; SILVEIRA, CYNTHIA; LACARRUBBA'FLORES, MARIA D. J.; CARVALHO, B. S.; CAVALCANTI, DENISE P. Molecular diagnosis in a cohort of 114 patients with rare skeletal dysplasias. AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART C-SEMINARS IN MEDICAL GENETICS (ISSN: 15524868). v. 187. 2021.
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SILVA-COSTA, LICIA C.; SMITH, BRADLEY J.; CARREGARI, VICTOR CORASOLLA; SOUZA, GUSTAVO H.M.F.; VIEIRA, ERICA M.; MENDES-SILVA, ANA PAULA; DE ALMEIDA, VALÉRIA; CARVALHO, B. S.; DINIZ, BRENO S.; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL Plasma proteomic signature of major depressive episode in the elderly. Journal of Proteomics (ISSN: 18743919). v. 269. 2022.
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CANTO, AMANDA M.; GODOI, ALEXANDRE B.; MATOS, ALEXANDRE H. B.; GERALDIS, JAQUELINE C.; ROGERIO, FABIO; ALVIM, MARINA K. M.; YASUDA, CLARISSA L.; GHIZONI, ENRICO; TEDESCHI, HELDER; VEIGA, DIOGO F. T.; HENNING, BARBARA; SOUZA, WELLITON; ROCHA, CRISTIANE S.; VIEIRA, ANDRÉ S.; DIAS, ELAYNE V.; CARVALHO, B. S.; GILIOLI, ROVILSON; ARUL, ALBERT B.; ROBINSON, RENÃ A. S.; et.al Benchmarking the proteomic profile of animal models of mesial temporal epilepsy. Annals of Clinical and Translational Neurology (ISSN: 23289503). v. 9. 2022.
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CANTO, AMANDA M.; MATOS, ALEXANDRE H. B.; GODOI, ALEXANDRE B.; VIEIRA, ANDRÉ S.; AOYAMA, BEATRIZ B.; ROCHA, CRISTIANE S.; HENNING, BARBARA; CARVALHO, B. S.; PASCOAL, VINICIUS D.B.; VEIGA, DIOGO F. T.; GILIOLI, ROVILSON; CENDES, FERNANDO; LOPES'CENDES, ISCIA Multi-omics analysis suggests enhanced epileptogenesis in the 3 of the pilocarpine model of mesial temporal lobe epilepsy. HIPPOCAMPUS (ISSN: 10509631). v. 31. 2021.
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LACARRUBBA'FLORES, MARIA DORA JAZMIN; DA COSTA SILVEIRA, KARINA; SILVEIRA, CYNTHIA; CARVALHO, B. S.; CAVALCANTI, DENISE PONTES A mesomelic skeletal dysplasia, Kantaputra-like, not related to cluster region, and with phenotypic gender differences. AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART A (ISSN: 15524825). v. 194. 2024.
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URBANSKI, ALYSSON HENRIQUE; FREITAS, FLÁVIA CRISTINA DE PAULA; GOMES, TIAGO MINUZZI FREIRE DA FONTOURA; SCHEMBERGER, MICHELLE ORANE; REIS, BÁRBARA CARVALHO SANTOS DOS; CARVALHO, FLAVIA AMÊNDOLA ANÍSIO DE; FACCION, ROBERTA SOARES; MACHADO, LUCAS DE ALMEIDA; SANTOS, DEBORAH ANTUNES DOS; CUNHA, DANIELA PRADO; SALÚ, MARGARIDA DOS SANTOS; MOORE, DANIELLA CAMPELO BATALHA COX; PRESIBELLA, MAYRA MARINHO; NOGUCHI, JULIANA FONTES; BORGES, HENRIQUE LIRA; TOMIURA, LAIS KIMIE; SILVA DE CASTRO, LUIZA; SANTOS, LETÍCIA GRAZIELA COSTA; SILVA, ESDRAS MATHEUS GOMES DA; CARVALHO, B. S.; et.al Genetic Variants Affect Distinct Metabolic Pathways in Pediatric Multisystem Inflammatory Syndrome and Severe COVID-19. JOURNAL OF MEDICAL VIROLOGY (ISSN: 01466615). v. 97. 2025.
[ Google | Google Scholar ] [Qualis: Matemática / Probabilidade e Estatística: A1  ]
POSSIK, PATRICIA A.; ADAMS, DAVID J.; AGUIAR, FLAVIA C.; ALVES, TAMIRES CAIXETA; ALVES-HANNA, FABÍOLA S.; RESTREPO ARBOLEDA, CARLOS MARIO; ARMINGOL, ERICK; ARRUDA, LIÃ BÁRBARA; ASTROZ, YESID CUESTA; BOCCACINO, JACQUELINE M.; BONFIM, DANIELLE C.; CALDERON, JUAN F.; MURILLO CARRASCO, ALEXIS GERMÁN; CARVALHO, DANIELLE G.; CARVALHO, B. S.; SANCHES DALTRO DE CARVALHO, PAULO VINÍCIUS; CASTRO, ALEX; CHAPPELL, LIA; CHINCHILLA-MONGE, RICARDO; et.al Exploring Latin America one cell at a time. CELL (ISSN: 00928674). v. 188. 2025.
[ Google | Google Scholar ] [Qualis: Matemática / Probabilidade e Estatística: A1  ]
Capítulos de livros publicados
CARVALHO, B. S. Working with Oligonucleotide Arrays. 2016.
Resumos publicados em anais de congressos
CARVALHO, B. S.; HENNING, BARBARA; DE ARAUJO, TÂNIA K.; TADIELLO, H.; COAN, ANA C.; MONTENEGRO, MARIA AUGUSTA; ALVIM, MARINA K. M.; YASUDA, CLARISSA L.; CENDES, FERNANDO; LOPES-CENDES, I. Revealing disease genetics: unveiling genetic architecture through differential copy number variation in admixed populations. 2023.
Apresentações de Trabalho
CARVALHO, B. S.; SOUZA, W.; CENDES, I. T. L. RNNR: distributed task execution system for scaling reproducible workflows (pôster). 2023.
CARVALHO, B. S. Do Código à Cura Ciência de Dados e Condições Neurológicas. 2023.
CARVALHO, B. S. Precision Medicine in Brazil. 2023.
CARVALHO, B. S. From statistical models to medical practice: how interdisciplinarity may lead the way to excellence in health care. 2020.

Orientações

Orientações de Pós-Doutorado
Prianda Rios Laborda, Benilton de Sa Carvalho () . POS_DOUTORADO. . 2021.
Orientações de Doutorado
Barbara Henning da Silva, Benilton de Sa Carvalho (CO_ORIENTADOR) Thermoregulation in small mammals:from mechanisms at the organism levelto ecological consequences. DOUTORADO. . 2016.
Welliton de Souza, Benilton de Sa Carvalho (CO_ORIENTADOR) Desenvolvimento e otimização de protocolos e ferramentas em bioinformática através de técnicas de computação de alto desempenho para uso no processamento de dados biológicos de larga escala. DOUTORADO. . 2016.
Orientações de Mestrado
Heidi Mara de Sousa , Benilton de Sa Carvalho (ORIENTADOR_PRINCIPAL) Estudo de Modelos de Classificação com Aplicação a Dados Genômicos. MESTRADO. . 2019.
Murilo Soares Pinheiro, Benilton de Sa Carvalho (CO_ORIENTADOR) Detecção de Pontos de Mudança e Aplicaçõesem Genética. MESTRADO. . 2017.
Welliton de Souza, Benilton de Sa Carvalho (CO_ORIENTADOR) ANÁLISE E DESENVOLVIMENTO DE PROTOCOLOS EM BIOINFORMÁTICA PARA ESTUDOS DE EPIGENÉTICA. MESTRADO. . 2016.
André Felipe Berdusco Menezes , Benilton de Sa Carvalho (ORIENTADOR_PRINCIPAL) Métodos estatísticos para modelagem de dados de scRNA-seq. MESTRADO. . 2021.
Carolina Peçaibes de Oliveira , Benilton de Sa Carvalho (ORIENTADOR_PRINCIPAL) Avaliação da Adequabilidade Estatística e Transparência de Metadados em Estudos Clínicos Disponíveis no ClinicalTrials.gov. MESTRADO. . 2024.
Daniel Lopes Toso, Benilton de Sa Carvalho (ORIENTADOR_PRINCIPAL) Transfer-Learning para Identificação de Preditores Morfológicos em Câncer de Ovário Seroso de Alto Grau. MESTRADO. Em andamento. 2026.
Carolina Peçaibes de Oliveira , Benilton de Sa Carvalho (ORIENTADOR_PRINCIPAL) Deep Learning Aplicado à Estudos de Expressão Gênica. MESTRADO. Em andamento. 2022.
Bruna Caroline Dias da Silva, Benilton de Sa Carvalho (ORIENTADOR_PRINCIPAL) Modelos Preditivos de Classificação Aplicados à Biologia Molecular. MESTRADO. Em andamento. 2022.
Mariângela Lima Rodrigues, Benilton de Sa Carvalho (ORIENTADOR_PRINCIPAL) Quantificação Gênica em scRNA-Seq por Aprendizado de Máquina. MESTRADO. Em andamento. 2022.
Leandro Marrafon Bartalini , Benilton de Sa Carvalho (ORIENTADOR_PRINCIPAL) Modelos de Regressão para Testes de Associação Genética. MESTRADO. Em andamento. 2020.
Alexis Marichi Zela , Benilton de Sa Carvalho (ORIENTADOR_PRINCIPAL) Fundamentos de Redução de Dimensionalidade em Dados de Sequenciamento de Célula Única. MESTRADO. Em andamento. 2025.
Lucas Luiz de Castro Gomes, Benilton de Sa Carvalho (ORIENTADOR_PRINCIPAL) Deconvolução de Tipos Celulares em Dados de Sequenciamento de RNA com Orientação Espacial. MESTRADO. Em andamento. 2025.
Shanda Andrea Huillca Torres , Benilton de Sa Carvalho (ORIENTADOR_PRINCIPAL) Modelos Hierárquicos Aplicados à Modelagem de Dados de scRNA-Seq com Ênfase em Ancestralidade Local. MESTRADO. Em andamento. 2025.
Orientações de Iniciação Científica
Guilherme Artoni, Benilton de Sa Carvalho () Ambiente de Alta-Performance para Processamento de Dados de Microarranjos. INICIACAO_CIENTIFICA. . 2018.
Mariangela Lima Rodrigues, Benilton de Sa Carvalho () Métodos Estatísticos em Microarranjos de Polimorfismos de Base Única. INICIACAO_CIENTIFICA. . 2020.
Bruna Caroline Dias Silva, Benilton de Sa Carvalho () Métodos Estatísticos em Microarranjos de Expressão. INICIACAO_CIENTIFICA. . 2020.
Mauricio de Sousa Araujo, Benilton de Sa Carvalho () Aprendizado Estatístico de Máquina. INICIACAO_CIENTIFICA. . 2020.
Mateus Costa Trentini, Benilton de Sa Carvalho () Estratégia de Aprendizado Estatístico de Máquina Aplicada a Dados de single-cell RNA-Seq. INICIACAO_CIENTIFICA. . 2022.
Outras Orientações
Eduardo dos Santos Neres, Benilton de Sa Carvalho () Introdução à Estatística Moderna. ORIENTACAO-DE-OUTRA-NATUREZA. . 2021.
Eduardo dos Santos Neres, Benilton de Sa Carvalho () Introdução à Estatística Moderna. ORIENTACAO-DE-OUTRA-NATUREZA. . 2022.
Eduardo dos Santos Neres, Benilton de Sa Carvalho () Introdução à Estatística Moderna. ORIENTACAO-DE-OUTRA-NATUREZA. . 2023.
Eduardo dos Santos Neres, Benilton de Sa Carvalho () Introdução à Estatística Moderna. ORIENTACAO-DE-OUTRA-NATUREZA. . 2024.
Mauricio de Sousa Araujo, Benilton de Sa Carvalho () Aprendizado Estatístico de Máquina. ORIENTACAO-DE-OUTRA-NATUREZA. . 2021.
Larissa Ribeiro da Silva, Benilton de Sa Carvalho () Aprendizado Estatístico de Máquina. ORIENTACAO-DE-OUTRA-NATUREZA. . 2021.
Mauricio de Sousa Araujo, Benilton de Sa Carvalho () Aprendizado Estatístico de Máquina. ORIENTACAO-DE-OUTRA-NATUREZA. . 2021.
Antonio Donizetti Lucas Junior, Benilton de Sa Carvalho () Apoio ao Laboratório de Biologia Computacional e Bioestatística. ORIENTACAO-DE-OUTRA-NATUREZA. . 2021.
Leonardo Almeida Santana, Benilton de Sa Carvalho () Apoio ao Laboratório de Biologia Computacional e Bioestatística. ORIENTACAO-DE-OUTRA-NATUREZA. . 2021.
Natalia Martins de Paiva, Benilton de Sa Carvalho () Apoio ao Laboratório de Biologia Computacional e Bioestatística. ORIENTACAO-DE-OUTRA-NATUREZA. . 2023.
Natalia Martins de Paiva, Benilton de Sa Carvalho () Apoio ao Laboratório de Biologia Computacional e Bioestatística. ORIENTACAO-DE-OUTRA-NATUREZA. . 2022.
Natalia Martins de Paiva, Benilton de Sa Carvalho () Apoio ao Laboratório de Biologia Computacional e Bioestatística. ORIENTACAO-DE-OUTRA-NATUREZA. . 2024.

Participações em Bancas

Participações em Banca de Concursos Públicos
Professor Classe A, Adjunto, Nível 1, Bioinformática. CONCURSO_PUBLICO. Universidade Federal de Viçosa.CARVALHO, BENILTON S2016.
Concurso Professor Adjunto A. CONCURSO_PUBLICO. Universidade Federal da Bahia.Gomes, G. S. S.; Cysneiros, F. J. A.; Ferreira, M. R. P.; RODRIGUES, P. J. C.; PEREIRA, M. B.; ANDRADE FILHO, M. C.; CARVALHO, BENILTON S2021.
Outras Participações em Bancas Julgadoras
Banca de Correção de Vestibular. OUTRAS_BANCAS_JULGADORAS. Universidade Estadual de Campinas.Martins, R. M.; Novaes, D. D.; CARVALHO, BENILTON S2021.
Banca de Correção de Vestibular. OUTRAS_BANCAS_JULGADORAS. Universidade Estadual de Campinas.Martins, R. M.; Novaes, D. D.; CARVALHO, BENILTON S2022.
(IC/UNICAMP) Prêmio de Reconhecimento Docente pela Dedicação ao Ensino de Graduação. OUTRAS_BANCAS_JULGADORAS. Universidade Estadual de Campinas.CARVALHO, BENILTON S; EVORA, F. R. R.; MARTINEZ, L.2023.
Participações em Banca de Doutorado
Renato Augusto Corrêa dos Santos. Genomic analysis of aspergillus cryptic species. DOUTORADO. Doutorado em Biologia Funcional e Molecular. Universidade Estadual de Campinas.CARVALHO, BENILTON S2021.
Fernanda Lang Schumacher. Robust linear mixed models for longitudinal data using skewed and heavy-tailed distributions. DOUTORADO. Estatística. Universidade Estadual de Campinas.MATOS, L. A.; CARVALHO, B. S.; BRANCO, M. D.; RUSSO, C. M.; NOBRE, J. S.2021.
Carlos Eduardo Martins Relvas. Clusterizacão baseada em modelos de mistura gaussianas com covariáveis. DOUTORADO. . Universidade de São Paulo.CARVALHO, BENILTON S2020.
Cesar Augusto Prada Medina. Estudando a artrite idiopática juvenil mediante uma abordagem de medicina de redes. DOUTORADO. Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia). Universidade de São Paulo.CARVALHO, BENILTON S2019.
Natália Faraj Murad. Redes de regulação gênica para identificar adaptações de duas raças de Spodoptera frugiperda a diferentes dietas. DOUTORADO. Biologia Funcional e Molecular. Universidade Estadual de Campinas.CARVALHO, BENILTON S.2018.
Fernando Cipriano de Andrade Oliveira. Arquitetura genética dos genes codificadores de proteínas ligantes de RNA. DOUTORADO. Bioinformática. Universidade de São Paulo.CARVALHO, BENILTON S2017.
Gilderlanio Santana de Araújo. Network-based methods for analyzing the genetics of human complex diseases. DOUTORADO. Bioinformática. Universidade Federal de Minas Gerais.CARVALHO, BENILTON S2017.
Vinícius Jardim Carvalho. A expressão de Epirregulina e o papel dual dos macrófagos pró-inflamátorios no microambiente tumoral de Carcinoma Pulmonar de Células Não Pequenas. DOUTORADO. Bioinformática. Universidade de São Paulo.FUJITA, A.; CARVALHO, BENILTON S; MARTINS, M. L. B.; REIS, E. M. R.2023.
Claudia Evelyn Escobar Montecino. Using VAE for Incomplete Educational Data. DOUTORADO. Estatística. Universidade de São Paulo.CURI, M.; ASSUNCAO, R. M.; BURGOS, J. A. G.; CARVALHO, BENILTON S; MELLO, R. F.2023.
Participações em Banca de Mestrado
André Felipe Berdusco Menezes. Métodos estatísticos para modelagem de dados de scRNA-seq. MESTRADO. Estatística. Universidade Estadual de Campinas.CARVALHO, BENILTON S2021.
André Alexandre Rodrigues Besouro Duarte. Alternative splicing-mediated cis-regulation in breast cancer risk. MESTRADO. Oncobiologia. Universidade do Algarve.CARVALHO, BENILTON S2021.
Ana Cláudia Martins Ciconelle. Detecção de copy number variation (CNV) e sua caracterização na população brasileira. MESTRADO. Bioinformática. Universidade de São Paulo.CARVALHO, BENILTON S2018.
Antônio Pedro de Castello Branco da Rocha Camargo. Análise do transcriptoma associado a lincRNAs no sistema olfativo acessório. MESTRADO. Biologia Funcional e Molecular. Universidade Estadual de Campinas.CARVALHO, BENILTON S2018.
Francisco Ivanio Arruda Alves. Análise de transcritomas de células de pacientes xeroderma pigmentosum após irradiação com luz UVA e estudo de retrocópias de genes de reparo. MESTRADO. . Universidade Estadual de Campinas.CARVALHO, BENILTON S2017.
Juan Manuel Vidal Garcia. Estudo comparativo de duas estratégias utilizadas na busca de relações funcionais entre genes. MESTRADO. . Universidade de São Paulo.CARVALHO, BENILTON S2016.
Henrique Cursino Vieira. Desenvolvimento de um pipeline para análise genômica de metilação do DNA. MESTRADO. . Universidade de São Paulo.CARVALHO, BENILTON S2016.
Nury Bibiana Riaño Gaona. Modelagem conjunta de dados longitudinais e de sobrevivência com risco competitivo e tempo discreto: Aplicação em dados de evasão estudantil. MESTRADO. Estatística. Universidade Estadual de Campinas.MAIA, R. P.; LOBOS, C. M. V.; CARVALHO, BENILTON S.; GAOA, N. B. R.2022.
Camila Alves de Souza. Mapeamento e estudo de associação de Variações no Número de Cópias de DNA (CNVs) e de Regiões com Perda de Heterozigozidade (LOH) com fenótipos complexos. MESTRADO. Bioinformática. Universidade de São Paulo.SOLER, J. M. P.; CARVALHO, BENILTON S; PINHEIRO, H. P.; ROGERO, M. M.2022.
Heidi Mara do Rosário Sousa. Estudo de modelos de classificação com aplicação a dados genômicos. MESTRADO. Estatística. Universidade Estadual de Campinas.CARVALHO, BENILTON S2019.
Participações em Banca de Exame de Qualificação
Renato Augusto Corrêa dos Santos. Análise genômica de espécies crípticas de Aspergillus. EXAME_QUALIFICACAO. Genética e Biologia Molecular. Universidade Estadual de Campinas.SANTOS, R. V.; CARVALHO, BENILTON S; GALANTE, P. A. F.2020.
Estudo da Contribuição de Retrocópias na Origem de Novas Reg. Estudo da Contribuição de Retrocópias na Origem de Novas Regiões Gênicas. EXAME_QUALIFICACAO. Bioinformática. Universidade de São Paulo.CARVALHO, BENILTON S2020.
Jorge Francisco Cutigi. Investigation of computational methods for identifying significant mutations in cancer. EXAME_QUALIFICACAO. . Universidade de São Paulo.CARVALHO, BENILTON S2019.
Sheila Tiemi Nagamatsu. Variações gênicas e transcricionais associadas a vantagens evolutivas e robustez em leveduras industriais de produção de etanol 1G e 2G. EXAME_QUALIFICACAO. Genética e Biologia Molecular. Universidade Estadual de Campinas.CARVALHO, BENILTON S2017.
Fábio Malta de Sá Patroni. Identificação dos genes regulados pelas diferentes isoformas de HIF-3$\alpha$: desenvolvimento de ferramenta de análise de dados de transcriptômica de tumores de pacientes. EXAME_QUALIFICACAO. Genética e Biologia Molecular. Universidade Estadual de Campinas.CARVALHO, BENILTON S2017.
Antônio Pedro de Castello Branco da Rocha Camargo. Análise do transcriptoma associado a lincRNAs no sistema olfativo acessório. EXAME_QUALIFICACAO. Genética e Biologia Molecular. Universidade Estadual de Campinas.CARVALHO, BENILTON S2017.
Juan Sebastián Beleño Díaz. Semantic seach on scientific workflow repositories. EXAME_QUALIFICACAO. Ciência da Computação. Universidade Estadual de Campinas.CARVALHO, BENILTON S2016.
Ana Cláudia Martins Ciconelle. Detecção de Copy Number Variation e sua caracterização na população Brasileira. EXAME_QUALIFICACAO. . Universidade Estadual de Campinas.CARVALHO, BENILTON S2016.
Raphael Bruno Amemiya. Análise de ancestralidade genética da população de São Paulo. EXAME_QUALIFICACAO. Bioinformática. Universidade de São Paulo.MATIOLI, S. R.; NASLAVSKY, M. S.; CARVALHO, BENILTON S2022.
Mariene Ribeiro Amorim. Estudo genômico-epidemiológicos do vírus sars-cov-2 na região de Campinas, São Paulo, Brasil. EXAME_QUALIFICACAO. Genética e Biologia Molecular. Universidade Estadual de Campinas.CARVALHO, BENILTON S2022.

Participação em eventos

CARVALHO, B. S. Applications of statistics in the biomedical field. 2022.
CARVALHO, B. S. The Brazilian Initiative on Precision Medicine: Strategies and Findings - A glimpse into Global Bioinformatics Communities: Latin America. 2020.
CARVALHO, B. S. Advances by BIPMed. 2020.
CARVALHO, B. S. RNNR: distributed task execution system for scaling reproducible workflows. 2023.
CARVALHO, B. S. Revealing disease genetics: unveiling genetic architecture through differential copy number variation in admixed populations. 2023.
CARVALHO, B. S. RNNR: distributed task execution system for scaling reproducible workflows. 2023.
CARVALHO, B. S. Brazilian Initiative on Precision Medicine: Statistical Perspectives. 2017.
CARVALHO, B. S. Big data e dados de pesquisa em saúde. 2018.
CARVALHO, B. S. A method to unveil the genetic architecture of diseases through differential copy number variation in an admixed population. 2022.
CARVALHO, B. S. ABE e a COVID-19: Ações e Desafios. 2022.
CARVALHO, B. S. How can CABANA become auto-suficient?. 2022.
CARVALHO, B. S. End-to-End Implementations of GA4GH Standards at BIPMed. 2021.
CARVALHO, B. S. Desenvolvimentos da Iniciativa Brasileira em Medicina de Precisão. 2021.
CARVALHO, B. S. Métodos estatísticos para detecção de mutações e para identificação de genes associados a fenótipos de interesse. 2018.
CARVALHO, B. S. Avanços na tecnologia de informação e impacto no diagóstico e terapêutica do câncer: o exemplo do big data. 2018.
CARVALHO, B. S. Identificação de Variantes Raras em Estudos Genômicos. 2019.
CARVALHO, B. S. Perspectivas da Ciência Aberta no Brasil. 2019.
CARVALHO, B. S. New BIPMed Products. 2019.
CARVALHO, B. S. Open Science in Brazil. 2023.
CARVALHO, B. S. Análise Federada de Dados Genômicos. 2023.
CARVALHO, B. S. Computational Biology: new approaches to understand human diseases. 2020.
CARVALHO, B. S. Gestão de dados na Unicamp. 2018.

Organização de eventos

GARCIA, N. L.; SOUSA, A. R. S.; CARVALHO, B. S.; MOTTA, M. R.; MATOS, L. A.; KIIHL, S. F.; CARVALHO, T. A. B. VI Escola de Amostragem e Métodos de Pesquisa. 2023.
CARVALHO, B. S. VI GBMeeting. 2024.
CARVALHO, B. S. Ciclo de Webinários - ABE e a COVID-19: Ações e Desafios. 2020.